Die besonderen Chancen des BEM ergeben sich vor allem aus der vertrauensvollen Kooperation zwischen Betroffenen und Ansprechpartnern bei der Problemklärung und -lösungssuche. Es ist ein sensibler Prozess zwischen Problemlösung und Hilfsangebot einerseits sowie Offenlegung von persönlichen gesundheitsbezogenen Problemlagen andererseits.
Das setzt einen datengeschützten Rahmen voraus, der es erlaubt, die Gesprächsinhalte unter Verschluss zu halten und nur solche gefilterten Informationen aus dem Gespräch weiterzugeben, die für die Realisierung von Maßnahmen notwendig sind. Eine „Zweckentfremdung“ der Informationen, z.B. für sonstige Personalentscheidungen, muss durch den Datenschutz ausgeschlossen werden. Vor allem die Gesprächspartner müssen deshalb auf den Datenschutz verpflichtet werden.